Somero Deutschland arbeitet eng mit einer ugandischen Partnerorganisation, Somero Uganda, zusammen Die Zusammenarbeit zeichnet sich durch regelmäßigen Austausch zwischen dem Koordinator in Uganda und dem Team in Deutschland aus. Durch die langjährige Zusammenarbeit besteht ein stabiles Vertrauensverhältnis zwischen den beiden Teams.
Vor Ort werden die Projekte durch die hauptamtlichen Mitarbeiter von Somero Uganda eigenständig geplant und umgesetzt. Die ehrenamtlichen Mitglieder des deutschen Somero Teams sind primär für inländische Informationsarbeit und Spendenakquise zuständig. Es finden regelmäßige virtuelle Treffen via Skype zwischen beiden Partnerorganisationen statt. Darüber hinaus finden in regelmäßigen Abständen Reisen von deutschen Vereinsmitgliedern nach Uganda und von ugandischen Vereinsmitgliedern nach Deutschland statt.